如果软件是两家企业都掌握源程序的，可以有几种方式分享著作权，但无论哪一种都应当事先签订协议明确各自的权利义务。

　　这里我不推荐两家公司签订问题中提及的使用权协议或者转让协议，如果是使用权协议的，就是一家拥有著作权，授权另一家使用，授权方式有三种：独占、排他、普通。独占的情况下，权利方也是无权使用的，排他也不好，因为这种情况下，一般是两家共同研发的软件，凭什么是你授权我而不是我授权你?容易起争议。一般授权的话权利方除了可以授权对方使用，还可以授权第三方，后续争议更大。而转让协议也没法操作，如果你出让了著作权，自己就没法使用了。所以我建议两家各自把软件以自己的名义登记著作权。实践中，一般谁享有著作权以登记为准，而著作权登记一般是不允许两个公司以共有方式作为著作权人的(前几年肯定不可以，这两年不知道有没有变化)，因为这个限制，所以两方可以在登记前事先签订软件归属协议，明确双方各自对软件的权利，建议源程序双方都有权用，但新开发出的内容归各自所有，双方各自使用的品牌以及不得侵犯对方的品牌，不得抄袭对方的文档、美术作品，同时还要约定各自是不是有权对第三方进行授权、是不是有权出让软件著作权等等。

　　本公司专业办理软件著作权登记代理,可加急，希望有机会合作.

　　1：找不负责任代理容易出现补正：

　　补证可能要很长时间通过不了，耽误您时间还耽误您做项目 ，得不偿失;

　　2：我们代理著作权基本不会出现补证现象，即使出现立即就能想出解决方案。

　　同时我们安排专职外勤，可以直接找到负责的老师，直接补证，尽最大可能的缩短认证的时间。

　　3：我们整理材料对您不利情况都是不会出现的。很多细节上的小问题我们都会注意。

　　4：如果登记著作权请务必找专业负责有经验代理单位。

　　主要是信息采集表，说明书和代码给我们电子版，发给我们，我们做出资料您配合盖章，其它提交、受理、取证都是我们来做。